“211工程”所需建設(shè)資金，采取國家、部門、地方和高等學校共同籌集的方式解決。按現(xiàn)行高等教育管理體制，建設(shè)資金主要由學校所屬的部門和地方政府籌措安排，中央安排一定的專項資金給予支持，對工程建設(shè)起推動、指導和調(diào)控作用。
部門和地方政府的專項資金，優(yōu)先保證國家重點學科、高等教育公共服務(wù)體系建設(shè)的需要，并安排好有關(guān)高等學校上水平所必須的基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)。中央專項資金主要用于國家重點學科和高等教育公共服務(wù)體系的建設(shè)，補助少數(shù)高等學校整體水平提高所需基礎(chǔ)設(shè)施的建設(shè)。
“九五”期間，“211工程”在99所高校中實施建設(shè)，主要安排了602個重點學科和兩個全國高等教育公共服務(wù)體系建設(shè)項目。
“十五”期間，“211工程”在107所大學中實施建設(shè)，主要安排了821個重點學科和三個全國高等教育公共服務(wù)體系建設(shè)項目。
到2005年，中國共計75個學科進入了ESI的數(shù)據(jù)庫中前1%，涉及到21所高校，而這些高校全部都是“211工程”的學校，而且主要集中在材料科學、化學、物理學、工程學和計算機學科，這些學科都是“211工程”的重點建設(shè)的學科。
根據(jù)ESI所提供的統(tǒng)計結(jié)果，清華大學材料學科在1995年到2005年期間發(fā)表的SCI論文總數(shù)為3677篇，排在世界大學的第二位，這個學科在世界排在第二位。
根據(jù)ESI數(shù)據(jù)統(tǒng)計結(jié)果，1995到2005年的“211工程”建設(shè)十年當中，北京大學化學學科在SCI發(fā)表的論文數(shù)是4526篇，列世界大學的第15位，論文引用數(shù)是23778位，排在世界大學的第103位。
中南大學發(fā)揮有色金屬資源與材料領(lǐng)域長期積淀的學科特色，以先進的有色稀有金屬與粉末有金材料，有色金屬資源快速勘察與可持續(xù)發(fā)展等“211工程”建設(shè)項目為紐帶，然后建成了在地質(zhì)、采礦、選礦、冶金、材料、機械六大領(lǐng)域，以國家重點學科為支撐，完備的有色金屬材料與資源學科創(chuàng)新體系。
清華大學就面向國家發(fā)展的戰(zhàn)略需求，對信息能源、材料等學科進行了布局調(diào)整，推進學科群的建設(shè)。
南京大學采用學科特區(qū)的建設(shè)模式，這對某一些學科非常重要，由于高校內(nèi)部的體制不一定整體上能夠到位，可以在有局部建立一些學科布局，這吸取了中國經(jīng)濟建設(shè)像深圳特區(qū)的一些發(fā)展和經(jīng)驗。