山東大學齊魯醫學院醫學學科建設體系具有齊魯醫學特色：
一是聚焦生殖健康與出生缺陷、心血管病發生與防治、腫瘤發生與防治和微生物與藥物研發4個重點方向，建設“臨床醫學與重大疾病”世界一流醫學學科群；
二是實施心血管病學、生殖醫學、藥學優勢特色學科，以及精準腫瘤學、腦科學新興交叉學科5個山東大學高峰學科建設項目；
三是立項實施預防醫學與公共衛生學、口腔頜面部組織的再生修復與重建、健康管理交叉學科、實驗畸形學、醫學免疫學、急診醫學、臨床檢驗診斷學、消化病學8個醫學部重點學科建設項目和血液內科、耳鼻咽喉科學、神經病學、康復醫學4個培育學科建設項目。